Demonstration video of the automated section acquisition for Array Tomography

Author

Liyu Huang

Corresponding author

Julian Hoffmann

Participating institute

Institut für Automation und angewandte Informatik (IAI)

Genre

Sonstiges

Description

Das Video zeigt die automatisierte Schnittaufnahme von seriellen Ultramikrotomschnitten durch eine neue Methodik, welche mikrofluidische Kanäle einsetzt. Die Fluidkanäle bilden ein mikrofluidisches System mit niedriger Reynolds-Zahl, in dem sich die Kanäle und das Substrat gemeinsam bewegen. Die Kanäle entstehen durch eine Oberflächenfunktionalisierung des Substrats, die eine unterschiedliche Benetzbarkeit bewirkt.
Die Schnittaufnahme erfolgt in einem Zyklus von 4 Schritten. (1) Der Anfang des Schnittbandes wird innerhalb eines mikrofluidischen Kanals positioniert und die natürliche Bewegung der Formation des Schnittbandes schiebt die Schnitte innerhalb des Kanals. (2) Das Schnittband wird von der Diamandschneide gelöst und die Rückwärtsbewegung des Substrats für zur kompletten Abtrennung. (3) Eine dünne vorstehende Folie aus FEP schiebt das Schnittband komplett in den Kanal. (4) Das Substrat bewegt sich zur Seite um die Aufnahme eines weiteren Schnittbandes zu ermöglichen und der Zyklus beginnt von vorne.
Durch langsames Anheben des Substrats aus der Messerwanne setzen sich die Schnitte auf der Substratoberfläche ab und werden dauerhaft fixiert. Die so erzeugten Schnitte können auf den für Array Tomography üblichen Substraten abgelegt und somit mit einer Vielzahl von mikroskopischen Verfahren untersucht werden.

Keywords

Automation, Array Tomography, Microscopy, Ultramicrotomy, AT, CAT

Duration (hh:mm:ss)

00:01:46

Published on

18.01.2023

Subject area

Computer science

License

Creative Commons Attribution – ShareAlike 4.0 International