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Demonstration video of the automated section acquisition for Array Tomography

Autor

Liyu Huang

Korrespondierender Autor

Julian Hoffmann

Beteiligtes Institut

Institut für Automation und angewandte Informatik (IAI)

Genre

Sonstiges

Beschreibung

Das Video zeigt die automatisierte Schnittaufnahme von seriellen Ultramikrotomschnitten durch eine neue Methodik, welche mikrofluidische Kanäle einsetzt. Die Fluidkanäle bilden ein mikrofluidisches System mit niedriger Reynolds-Zahl, in dem sich die Kanäle und das Substrat gemeinsam bewegen. Die Kanäle entstehen durch eine Oberflächenfunktionalisierung des Substrats, die eine unterschiedliche Benetzbarkeit bewirkt.
Die Schnittaufnahme erfolgt in einem Zyklus von 4 Schritten. (1) Der Anfang des Schnittbandes wird innerhalb eines mikrofluidischen Kanals positioniert und die natürliche Bewegung der Formation des Schnittbandes schiebt die Schnitte innerhalb des Kanals. (2) Das Schnittband wird von der Diamandschneide gelöst und die Rückwärtsbewegung des Substrats für zur kompletten Abtrennung. (3) Eine dünne vorstehende Folie aus FEP schiebt das Schnittband komplett in den Kanal. (4) Das Substrat bewegt sich zur Seite um die Aufnahme eines weiteren Schnittbandes zu ermöglichen und der Zyklus beginnt von vorne.
Durch langsames Anheben des Substrats aus der Messerwanne setzen sich die Schnitte auf der Substratoberfläche ab und werden dauerhaft fixiert. Die so erzeugten Schnitte können auf den für Array Tomography üblichen Substraten abgelegt und somit mit einer Vielzahl von mikroskopischen Verfahren untersucht werden.

Schlagwörter

Automation, Array Tomography, Microscopy, Ultramicrotomy, AT, CAT

Laufzeit (hh:mm:ss)

00:01:46

Publiziert am

18.01.2023

Fachgebiet

Informatik

Lizenz

Creative Commons Namensnennung – Weitergabe unter gleichen Bedingungen 4.0 International

Auflösung 1280 x 720 Pixel
Seitenverhältnis 16:9
Audiobitrate 1522 bps
Audio Kanäle 1
Audio Codec aac
Audio Abtastrate 48000 Hz
Gesamtbitrate 362996 kbps
Container mov,mp4,m4a,3gp,3g2,mj2
Dauer 105.920000 s
Dateiname DIVA-2023-5_mp4.mp4
Dateigröße 4.806.071 byte
Bildwiederholfrequenz 25
Videobitrate 355353 kbps
Video Codec h264

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